Protein–RNA interactions for Protein: Q99614

TTC1, Tetratricopeptide repeat protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC1Q99614 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC1Q99614 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC1Q99614 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC1Q99614 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC1Q99614 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms