Protein–RNA interactions for Protein: Q96H35

RBM18, Probable RNA-binding protein 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM18Q96H35 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM18Q96H35 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM18Q96H35 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM18Q96H35 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBM18Q96H35 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM18Q96H35 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM18Q96H35 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM18Q96H35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM18Q96H35 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM18Q96H35 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM18Q96H35 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM18Q96H35 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM18Q96H35 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM18Q96H35 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms