Protein–RNA interactions for Protein: Q92963

RIT1, GTP-binding protein Rit1, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT1Q92963 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RIT1Q92963 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIT1Q92963 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIT1Q92963 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RIT1Q92963 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RIT1Q92963 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT1Q92963 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RIT1Q92963 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RIT1Q92963 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms