Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
STAG2Q8N3U4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
STAG2Q8N3U4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
STAG2Q8N3U4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
STAG2Q8N3U4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
STAG2Q8N3U4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
STAG2Q8N3U4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
STAG2Q8N3U4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms