Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO42Q6P3S6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO42Q6P3S6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FBXO42Q6P3S6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FBXO42Q6P3S6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms