Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAMEF20Q5VT98 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAMEF20Q5VT98 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms