Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SDK2Q58EX2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SDK2Q58EX2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SDK2Q58EX2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SDK2Q58EX2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SDK2Q58EX2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms