Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SDK2Q58EX2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SDK2Q58EX2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SDK2Q58EX2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SDK2Q58EX2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SDK2Q58EX2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SDK2Q58EX2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SDK2Q58EX2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SDK2Q58EX2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SDK2Q58EX2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SDK2Q58EX2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SDK2Q58EX2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SDK2Q58EX2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SDK2Q58EX2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SDK2Q58EX2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SDK2Q58EX2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SDK2Q58EX2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SDK2Q58EX2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SDK2Q58EX2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SDK2Q58EX2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SDK2Q58EX2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SDK2Q58EX2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SDK2Q58EX2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SDK2Q58EX2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SDK2Q58EX2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SDK2Q58EX2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SDK2Q58EX2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SDK2Q58EX2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SDK2Q58EX2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SDK2Q58EX2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SDK2Q58EX2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SDK2Q58EX2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SDK2Q58EX2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SDK2Q58EX2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SDK2Q58EX2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SDK2Q58EX2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SDK2Q58EX2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SDK2Q58EX2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SDK2Q58EX2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SDK2Q58EX2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SDK2Q58EX2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SDK2Q58EX2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SDK2Q58EX2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SDK2Q58EX2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SDK2Q58EX2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SDK2Q58EX2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SDK2Q58EX2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SDK2Q58EX2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SDK2Q58EX2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SDK2Q58EX2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SDK2Q58EX2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SDK2Q58EX2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SDK2Q58EX2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SDK2Q58EX2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SDK2Q58EX2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SDK2Q58EX2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SDK2Q58EX2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SDK2Q58EX2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SDK2Q58EX2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SDK2Q58EX2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDK2Q58EX2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDK2Q58EX2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SDK2Q58EX2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SDK2Q58EX2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SDK2Q58EX2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDK2Q58EX2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDK2Q58EX2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SDK2Q58EX2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDK2Q58EX2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SDK2Q58EX2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDK2Q58EX2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SDK2Q58EX2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SDK2Q58EX2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SDK2Q58EX2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SDK2Q58EX2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDK2Q58EX2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SDK2Q58EX2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SDK2Q58EX2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SDK2Q58EX2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SDK2Q58EX2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDK2Q58EX2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SDK2Q58EX2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SDK2Q58EX2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SDK2Q58EX2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDK2Q58EX2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDK2Q58EX2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SDK2Q58EX2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SDK2Q58EX2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SDK2Q58EX2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SDK2Q58EX2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDK2Q58EX2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SDK2Q58EX2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SDK2Q58EX2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SDK2Q58EX2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SDK2Q58EX2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SDK2Q58EX2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SDK2Q58EX2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SDK2Q58EX2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SDK2Q58EX2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SDK2Q58EX2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms