Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TYSND1Q2T9J0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TYSND1Q2T9J0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TYSND1Q2T9J0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms