Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.69
PTPRKQ15262 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PTPRKQ15262 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PTPRKQ15262 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRKQ15262 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRKQ15262 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PTPRKQ15262 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRKQ15262 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PTPRKQ15262 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PTPRKQ15262 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRKQ15262 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRKQ15262 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PTPRKQ15262 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.66
PTPRKQ15262 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PTPRKQ15262 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PTPRKQ15262 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
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