Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPRRQ15256 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPRRQ15256 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPRRQ15256 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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