Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPA4Q13156 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPA4Q13156 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPA4Q13156 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPA4Q13156 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
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