Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNH2Q12809 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNH2Q12809 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH2Q12809 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH2Q12809 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNH2Q12809 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNH2Q12809 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNH2Q12809 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNH2Q12809 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNH2Q12809 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH2Q12809 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KCNH2Q12809 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KCNH2Q12809 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
KCNH2Q12809 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNH2Q12809 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNH2Q12809 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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