Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH1Q08174 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH1Q08174 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDH1Q08174 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDH1Q08174 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms