Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG1Q02413 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DSG1Q02413 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DSG1Q02413 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DSG1Q02413 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms