Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GFRA1P56159 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GFRA1P56159 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFRA1P56159 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA1P56159 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.5 ms