Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARRES1P49788 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RARRES1P49788 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RARRES1P49788 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARRES1P49788 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARRES1P49788 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms