Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMA5P28066 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMA5P28066 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMA5P28066 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMA5P28066 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMA5P28066 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMA5P28066 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMA5P28066 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMA5P28066 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMA5P28066 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMA5P28066 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMA5P28066 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PSMA5P28066 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMA5P28066 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms