Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZBED1O96006 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZBED1O96006 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ZBED1O96006 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZBED1O96006 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
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