Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TSPAN12O95859 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSPAN12O95859 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSPAN12O95859 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TSPAN12O95859 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms