Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYNGR4O95473 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYNGR4O95473 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYNGR4O95473 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNGR4O95473 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNGR4O95473 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms