Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRDM1O75626 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRDM1O75626 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PRDM1O75626 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PRDM1O75626 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRDM1O75626 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PRDM1O75626 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM1O75626 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM1O75626 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM1O75626 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRDM1O75626 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PRDM1O75626 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms