Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCM3APO60318 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCM3APO60318 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MCM3APO60318 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MCM3APO60318 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms