Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC3O43617 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC3O43617 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TRAPPC3O43617 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRAPPC3O43617 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRAPPC3O43617 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms