Protein–RNA interactions for Protein: O15533

TAPBP, Tapasin, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAPBPO15533 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAPBPO15533 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAPBPO15533 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAPBPO15533 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAPBPO15533 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms