Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJE1A6NN92 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJE1A6NN92 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJE1A6NN92 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJE1A6NN92 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJE1A6NN92 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJE1A6NN92 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJE1A6NN92 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms