Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSFQ9UBX1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTSFQ9UBX1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTSFQ9UBX1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTSFQ9UBX1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms