Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD9

CLCF1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCF1Q9UBD9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CLCF1Q9UBD9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLCF1Q9UBD9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLCF1Q9UBD9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCF1Q9UBD9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCF1Q9UBD9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms