Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMPD4Q9NXE4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD4Q9NXE4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD4Q9NXE4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD4Q9NXE4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMPD4Q9NXE4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD4Q9NXE4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD4Q9NXE4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD4Q9NXE4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMPD4Q9NXE4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SMPD4Q9NXE4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SMPD4Q9NXE4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SMPD4Q9NXE4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD4Q9NXE4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD4Q9NXE4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SMPD4Q9NXE4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms