Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG2

NGB, Neuroglobin, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGBQ9NPG2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NGBQ9NPG2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NGBQ9NPG2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NGBQ9NPG2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NGBQ9NPG2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGBQ9NPG2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NGBQ9NPG2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGBQ9NPG2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGBQ9NPG2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NGBQ9NPG2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGBQ9NPG2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NGBQ9NPG2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGBQ9NPG2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGBQ9NPG2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGBQ9NPG2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NGBQ9NPG2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms