Protein–RNA interactions for Protein: Q9H944

MED20, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED20Q9H944 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED20Q9H944 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED20Q9H944 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MED20Q9H944 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MED20Q9H944 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MED20Q9H944 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms