Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWM7

SFXN3, Sideroflexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN3Q9BWM7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFXN3Q9BWM7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SFXN3Q9BWM7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFXN3Q9BWM7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFXN3Q9BWM7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms