Protein–RNA interactions for Protein: Q99853

FOXB1, Forkhead box protein B1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXB1Q99853 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXB1Q99853 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXB1Q99853 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXB1Q99853 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXB1Q99853 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXB1Q99853 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXB1Q99853 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOXB1Q99853 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXB1Q99853 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXB1Q99853 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXB1Q99853 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXB1Q99853 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXB1Q99853 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXB1Q99853 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXB1Q99853 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXB1Q99853 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXB1Q99853 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXB1Q99853 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms