Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACAP3Q96P50 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACAP3Q96P50 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ACAP3Q96P50 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ACAP3Q96P50 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms