Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRMT2BQ96GJ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRMT2BQ96GJ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRMT2BQ96GJ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRMT2BQ96GJ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRMT2BQ96GJ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRMT2BQ96GJ1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms