Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.15
CTTNBP2Q8WZ74 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC40.93■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40.92■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC40.89■■■■■ 4.14
CTTNBP2Q8WZ74 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CTTNBP2Q8WZ74 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CTTNBP2Q8WZ74 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CTTNBP2Q8WZ74 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.8■■■■■ 4.12
CTTNBP2Q8WZ74 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CTTNBP2Q8WZ74 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CTTNBP2Q8WZ74 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CTTNBP2Q8WZ74 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CTTNBP2Q8WZ74 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CTTNBP2Q8WZ74 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.11
CTTNBP2Q8WZ74 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CTTNBP2Q8WZ74 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CTTNBP2Q8WZ74 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CTTNBP2Q8WZ74 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CTTNBP2Q8WZ74 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CTTNBP2Q8WZ74 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
CTTNBP2Q8WZ74 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
CTTNBP2Q8WZ74 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
CTTNBP2Q8WZ74 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
CTTNBP2Q8WZ74 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CTTNBP2Q8WZ74 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC40.67■■■■■ 4.1
CTTNBP2Q8WZ74 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
CTTNBP2Q8WZ74 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
CTTNBP2Q8WZ74 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms