Protein–RNA interactions for Protein: Q8N456

LRRC18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC18Q8N456 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC18Q8N456 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC18Q8N456 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC18Q8N456 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC18Q8N456 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC18Q8N456 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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