Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFTPA2Q8IWL1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFTPA2Q8IWL1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFTPA2Q8IWL1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPA2Q8IWL1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SFTPA2Q8IWL1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SFTPA2Q8IWL1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SFTPA2Q8IWL1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFTPA2Q8IWL1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms