Protein–RNA interactions for Protein: Q719H9

KCTD1, BTB/POZ domain-containing protein KCTD1, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD1Q719H9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KCTD1Q719H9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCTD1Q719H9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCTD1Q719H9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCTD1Q719H9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCTD1Q719H9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCTD1Q719H9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KCTD1Q719H9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCTD1Q719H9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KCTD1Q719H9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KCTD1Q719H9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KCTD1Q719H9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KCTD1Q719H9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KCTD1Q719H9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms