Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.31■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.29■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
LRRC9Q6ZRR7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC39.22■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
LRRC9Q6ZRR7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.16■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
LRRC9Q6ZRR7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.09■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.07■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
LRRC9Q6ZRR7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.05■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
LRRC9Q6ZRR7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.96■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
LRRC9Q6ZRR7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
LRRC9Q6ZRR7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.4 ms