Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.75■■■■■ 6.19
LRRC9Q6ZRR7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
LRRC9Q6ZRR7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC52.33■■■■■ 5.97
LRRC9Q6ZRR7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.24■■■■■ 5.95
LRRC9Q6ZRR7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.02■■■■■ 5.92
LRRC9Q6ZRR7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.01■■■■■ 5.92
LRRC9Q6ZRR7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC51.86■■■■■ 5.89
LRRC9Q6ZRR7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.41■■■■■ 5.82
LRRC9Q6ZRR7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.68■■■■■ 5.7
LRRC9Q6ZRR7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.57■■■■■ 5.69
LRRC9Q6ZRR7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.24■■■■■ 5.63
LRRC9Q6ZRR7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.24■■■■■ 5.63
LRRC9Q6ZRR7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.2■■■■■ 5.63
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.15■■■■■ 5.62
LRRC9Q6ZRR7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.07■■■■■ 5.61
LRRC9Q6ZRR7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC49.86■■■■■ 5.57
LRRC9Q6ZRR7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC49.81■■■■■ 5.56
LRRC9Q6ZRR7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
LRRC9Q6ZRR7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
LRRC9Q6ZRR7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.33■■■■■ 5.49
LRRC9Q6ZRR7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.13■■■■■ 5.46
LRRC9Q6ZRR7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
LRRC9Q6ZRR7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
LRRC9Q6ZRR7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.97■■■■■ 5.43
LRRC9Q6ZRR7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
LRRC9Q6ZRR7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
LRRC9Q6ZRR7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.49■■■■■ 5.35
LRRC9Q6ZRR7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
LRRC9Q6ZRR7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
LRRC9Q6ZRR7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC48.3■■■■■ 5.32
LRRC9Q6ZRR7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
LRRC9Q6ZRR7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.22■■■■■ 5.31
LRRC9Q6ZRR7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.18■■■■■ 5.3
LRRC9Q6ZRR7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
LRRC9Q6ZRR7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.98■■■■■ 5.27
LRRC9Q6ZRR7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.87■■■■■ 5.25
LRRC9Q6ZRR7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
LRRC9Q6ZRR7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC47.59■■■■■ 5.21
LRRC9Q6ZRR7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
LRRC9Q6ZRR7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
LRRC9Q6ZRR7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.46■■■■■ 5.19
LRRC9Q6ZRR7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.17
LRRC9Q6ZRR7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.37■■■■■ 5.17
LRRC9Q6ZRR7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
LRRC9Q6ZRR7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.28■■■■■ 5.16
LRRC9Q6ZRR7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC47.26■■■■■ 5.16
LRRC9Q6ZRR7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
LRRC9Q6ZRR7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
LRRC9Q6ZRR7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.14■■■■■ 5.14
LRRC9Q6ZRR7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
LRRC9Q6ZRR7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
LRRC9Q6ZRR7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC46.96■■■■■ 5.11
LRRC9Q6ZRR7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.94■■■■■ 5.1
LRRC9Q6ZRR7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.9■■■■■ 5.1
LRRC9Q6ZRR7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
LRRC9Q6ZRR7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
LRRC9Q6ZRR7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.72■■■■■ 5.07
LRRC9Q6ZRR7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
LRRC9Q6ZRR7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
LRRC9Q6ZRR7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
LRRC9Q6ZRR7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
LRRC9Q6ZRR7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
LRRC9Q6ZRR7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
LRRC9Q6ZRR7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.22■■■■■ 4.99
LRRC9Q6ZRR7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
LRRC9Q6ZRR7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC46.21■■■■■ 4.99
LRRC9Q6ZRR7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
LRRC9Q6ZRR7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.16■■■■■ 4.98
LRRC9Q6ZRR7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC46.12■■■■■ 4.97
LRRC9Q6ZRR7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
LRRC9Q6ZRR7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.08■■■■■ 4.97
LRRC9Q6ZRR7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
LRRC9Q6ZRR7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
LRRC9Q6ZRR7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.88■■■■■ 4.94
LRRC9Q6ZRR7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.88■■■■■ 4.94
LRRC9Q6ZRR7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
LRRC9Q6ZRR7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
LRRC9Q6ZRR7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.82■■■■■ 4.93
LRRC9Q6ZRR7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
LRRC9Q6ZRR7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.78■■■■■ 4.92
LRRC9Q6ZRR7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC45.76■■■■■ 4.92
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.9
LRRC9Q6ZRR7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
LRRC9Q6ZRR7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
LRRC9Q6ZRR7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
LRRC9Q6ZRR7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
LRRC9Q6ZRR7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
LRRC9Q6ZRR7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
LRRC9Q6ZRR7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
LRRC9Q6ZRR7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
LRRC9Q6ZRR7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.48■■■■■ 4.87
LRRC9Q6ZRR7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC45.48■■■■■ 4.87
LRRC9Q6ZRR7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.48■■■■■ 4.87
LRRC9Q6ZRR7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
LRRC9Q6ZRR7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC45.44■■■■■ 4.87
LRRC9Q6ZRR7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
LRRC9Q6ZRR7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.41■■■■■ 4.86
LRRC9Q6ZRR7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.38■■■■■ 4.86
LRRC9Q6ZRR7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
LRRC9Q6ZRR7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.34■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms