Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3W7

SCYL2, SCY1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL2Q6P3W7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SCYL2Q6P3W7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SCYL2Q6P3W7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SCYL2Q6P3W7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SCYL2Q6P3W7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SCYL2Q6P3W7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SCYL2Q6P3W7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SCYL2Q6P3W7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCYL2Q6P3W7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCYL2Q6P3W7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms