Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PCNX4Q63HM2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCNX4Q63HM2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCNX4Q63HM2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCNX4Q63HM2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PCNX4Q63HM2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
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