Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM6

PRAMEF13, Putative PRAME family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF13Q5VWM6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF13Q5VWM6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF13Q5VWM6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAMEF13Q5VWM6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF13Q5VWM6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF13Q5VWM6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms