Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GNPTABQ3T906 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GNPTABQ3T906 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GNPTABQ3T906 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GNPTABQ3T906 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GNPTABQ3T906 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.33■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GNPTABQ3T906 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms