Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NEDD9Q14511 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEDD9Q14511 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NEDD9Q14511 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NEDD9Q14511 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NEDD9Q14511 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEDD9Q14511 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
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