Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGCGQ13326 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SGCGQ13326 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SGCGQ13326 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SGCGQ13326 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGCGQ13326 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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