Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CGNL1Q0VF96 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CGNL1Q0VF96 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CGNL1Q0VF96 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CGNL1Q0VF96 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CGNL1Q0VF96 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CGNL1Q0VF96 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms