Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCR8P51685 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR8P51685 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR8P51685 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCR8P51685 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR8P51685 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR8P51685 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR8P51685 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR8P51685 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR8P51685 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR8P51685 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR8P51685 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCR8P51685 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR8P51685 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR8P51685 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR8P51685 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCR8P51685 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR8P51685 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR8P51685 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR8P51685 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR8P51685 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCR8P51685 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR8P51685 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR8P51685 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR8P51685 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR8P51685 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR8P51685 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCR8P51685 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR8P51685 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR8P51685 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR8P51685 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCR8P51685 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR8P51685 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCR8P51685 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR8P51685 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR8P51685 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCR8P51685 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR8P51685 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCR8P51685 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR8P51685 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR8P51685 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR8P51685 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR8P51685 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR8P51685 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCR8P51685 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR8P51685 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR8P51685 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR8P51685 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR8P51685 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCR8P51685 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR8P51685 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR8P51685 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR8P51685 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCR8P51685 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR8P51685 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR8P51685 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCR8P51685 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR8P51685 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR8P51685 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR8P51685 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCR8P51685 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR8P51685 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR8P51685 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR8P51685 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCR8P51685 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR8P51685 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR8P51685 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR8P51685 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR8P51685 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR8P51685 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCR8P51685 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR8P51685 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR8P51685 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR8P51685 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR8P51685 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR8P51685 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCR8P51685 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR8P51685 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCR8P51685 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR8P51685 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR8P51685 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCR8P51685 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCR8P51685 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR8P51685 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR8P51685 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCR8P51685 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR8P51685 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCR8P51685 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR8P51685 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR8P51685 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCR8P51685 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR8P51685 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCR8P51685 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR8P51685 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR8P51685 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR8P51685 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR8P51685 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR8P51685 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR8P51685 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCR8P51685 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms