Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TSC2P49815 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSC2P49815 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSC2P49815 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSC2P49815 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSC2P49815 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSC2P49815 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSC2P49815 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TSC2P49815 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TSC2P49815 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TSC2P49815 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSC2P49815 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TSC2P49815 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSC2P49815 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSC2P49815 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TSC2P49815 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSC2P49815 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSC2P49815 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSC2P49815 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSC2P49815 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSC2P49815 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSC2P49815 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSC2P49815 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSC2P49815 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TSC2P49815 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC2P49815 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC2P49815 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC2P49815 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC2P49815 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC2P49815 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC2P49815 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC2P49815 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC2P49815 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC2P49815 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSC2P49815 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC2P49815 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC2P49815 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC2P49815 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC2P49815 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC2P49815 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC2P49815 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC2P49815 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSC2P49815 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TSC2P49815 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TSC2P49815 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSC2P49815 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSC2P49815 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSC2P49815 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSC2P49815 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TSC2P49815 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSC2P49815 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSC2P49815 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSC2P49815 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSC2P49815 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSC2P49815 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSC2P49815 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSC2P49815 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSC2P49815 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSC2P49815 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TSC2P49815 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSC2P49815 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSC2P49815 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TSC2P49815 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TSC2P49815 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
TSC2P49815 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TSC2P49815 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC2P49815 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC2P49815 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC2P49815 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC2P49815 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC2P49815 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSC2P49815 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSC2P49815 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSC2P49815 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TSC2P49815 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSC2P49815 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSC2P49815 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSC2P49815 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSC2P49815 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSC2P49815 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSC2P49815 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSC2P49815 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSC2P49815 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TSC2P49815 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSC2P49815 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSC2P49815 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSC2P49815 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSC2P49815 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TSC2P49815 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TSC2P49815 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSC2P49815 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSC2P49815 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSC2P49815 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSC2P49815 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSC2P49815 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSC2P49815 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSC2P49815 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSC2P49815 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSC2P49815 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSC2P49815 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms